ABSTRACT
Resumen La bacteria Klebsiella pneumoniae es la causante de infecciones intrahospitalarias multirresistentes, posee diversos mecanismos de resistencia como la producción de enzimas betalactamasas cuya acción afecta a los antibióticos betalactámicos. Objetivo: Caracterizar los mecanismos de resistencia presentes en aislados clínicos con Klebsiella pneumoniae identificados mediante métodos fenotípicos en el Hospital Monte Sinai desde enero de 2018 hasta agosto de 2020. Materiales y métodos: Estudio positivista con un enfoque cuantitativo de corte transversal descriptivo de diseño documental. La población estuvo conformada por 274 datos de aislados clínicos identificados con Klebsiella pneumoniae. Los cuales conformaron la totalidad de la muestra con un muestreo por cobertura total. Mismos que fueron recopilados de fuentes secundarias ingresados en la base de datos del departamento de Microbiología. Para el análisis se utilizó estadística descriptiva. Resultados: Klebsiella pneumoniae mostró mayor frecuencia en el año 2020 con el 35%. Se identificó al mecanismo de resistencia BLEE con el 27,7% y carbapenemasas tipo KPC con el 7.7 %, con mayor presencia en el sexo masculino. Presentó una mayor resistencia a Penicilinas, una sensibilidad moderada a Cefalosporinas, Aminoglucósidos, Quinolonas y una alta sensibilidad a los Carbapenémicos, Tigeciclina y Colistina. Los aislados se clasificaron como multidrogorresistentes, con mayor frecuencia en Urocultivo, Aspirado bronquial, Líquido corporal, Punta de Catéter y Hemocultivo en áreas de Hospitalización, UCI y Neonatología. Conclusiones: Los mecanismos de resistencia de K. pneumoniae a los antibióticos son un hallazgo común en ambientes hospitalarios independientemente de sexo, servicio hospitalario o tipo de muestra, convirtiéndose en un problema de salud pública.
Abstract The bacterium Klebsiella pneumoniae is the cause of multiresistant intrahospital infections, it has various resistance mechanisms such as the production of beta-lactamase enzymes whose action affects beta-lactam antibiotics. Objective: To characterize the resistance mechanisms present in clinical isolates with Klebsiella pneumoniae identified by phenotypic methods at Monte Sinai Hospital from January 2018 to August 2020. Materials and methods: Positivist study with a descriptive cross-sectional quantitative approach to documentary design. The population consisted of 274 data from clinical isolates identified with Klebsiella pneumoniae. Which made up the entire sample with a total coverage sampling. The same ones that were collected from secondary sources entered in the database of the Microbiology department. Descriptive statistics were used for the analysis. Results: Klebsiella pneumoniae showed a higher frequency in 2020 with 35%. The ESBL resistance mechanism was identified with 27.7% and KPC-type carbapenemases with 7.7%, with a higher presence in males. It presented a greater resistance to Penicillins, a moderate sensitivity to Cephalosporins, Aminoglycosides, Quinolones and a high sensitivity to Carbapenems, Tigecycline and Colistin. The isolates were classified as multidrug resistant, more frequently in Urine culture, Bronchial aspirate, Body fluid, Catheter Tip and Blood culture in Hospitalization, ICU and Neonatology areas. Conclusions: The resistance mechanisms of K. pneumoniae to antibiotics are a common finding in hospital settings regardless of sex, hospital service or type of sample, becoming a public health problem.
Resumo A bactéria Klebsiella pneumoniae é causa de infecções intra-hospitalares multirresistentes, possui diversos mecanismos de resistência como a produção de enzimas beta-lactamase cuja ação afeta os antibióticos beta-lactâmicos. Objetivo: Caracterizar os mecanismos de resistência presentes em isolados clínicos de Klebsiella pneumoniae identificados por métodos fenotípicos no Hospital Monte Sinai de janeiro de 2018 a agosto de 2020. Materiais e métodos: Estudo positivista com abordagem quantitativa transversal descritiva do design documental. A população consistia em 274 dados de isolados clínicos identificados com Klebsiella pneumoniae. O que constituiu toda a amostra com uma amostra de cobertura total. Os mesmos que foram coletados em fontes secundárias e cadastrados no banco de dados do departamento de Microbiologia. Estatísticas descritivas foram utilizadas para a análise. Resultados: Klebsiella pneumoniae apresentou maior frequência em 2020 com 35%. O mecanismo de resistência a ESBL foi identificado com 27,7% e carbapenemases do tipo KPC com 7,7%, com maior presença no sexo masculino. Apresentou maior resistência às Penicilinas, sensibilidade moderada às Cefalosporinas, Aminoglicosídeos, Quinolonas e alta sensibilidade aos Carbapenêmicos, Tigeciclina e Colistina. Os isolados foram classificados como multirresistentes, com maior frequência em Urocultura, Aspirado Brônquico, Fluido Corporal, Ponta de Cateter e Hemocultura em Hospitalização, UTI e Neonatologia. Conclusões: Os mecanismos de resistência de K. pneumoniae aos antibióticos são um achado comum em ambientes hospitalares independentemente do sexo, serviço hospitalar ou tipo de amostra, tornando-se um problema de saúde pública.
ABSTRACT
Resumen Las Infecciones del Tracto Urinario (ITU), constituyen uno de los principales motivos de consulta en el ámbito de atención primaria, debido al aumento de la resistencia antibacteriana. Objetivo . Caracterizar la prevalencia de infección del tracto urinario y el perfil de susceptibilidad antimicrobiana in vitro en Enterobacterias en los pacientes de la provincia de Santa Elena - Ecuador. Método . Esta investigación fue descriptiva de diseño documental. La población fue de 827 registros de urocultivos, recopilados de la base de datos del laboratorio de microbiología del Centro de Especialidades IESS La Libertad, en el período comprendido desde agosto 2019 hasta marzo de 2020. Los datos fueron procesados mediante estadística descriptiva, análisis de frecuencia y chi cuadrado. Resultados . De este estudio indican que la prevalencia de ITU fue 22,1%; los principales agentes etiológicos fueron: E. coli (76,0%), Klebsiella oxytoca (6,5%), Klebsiella pneumoniae (5,8%) y Proteus mirabilis (3,9%). La ITU y la infección por E. coli fueron estadísticamente mayores en mujeres y adultos mayores. La mayor frecuencia de resistencia de E. coli fue para ácido nalidíxico (81,2%), ampicilina (79,9%), ciprofloxacina (72,6%) y sulfametoxazol trimetoprima (61,5%); en Klebsiella oxytoca fue ampicilina (80,0%), sulfametoxazol trimetoprima (70,0%), ácido nalidíxico (60,0%) y ciprofloxacina (40,0%). Mientras que en Klebsiella pneumoniae se halló una resistencia del (100%) para ampicilina y cefalotina, amoxicilina y ácido clavulánico (66,7%), ciprofloxacina (55,6%), ácido nalidíxico (44,4%), meropenem e imipenem (11,1%). Conclusiones. La E. coli continúa siendo el microorganismo más frecuente en ITU. El tratamiento empírico de ITU debería incluir amikacina, nitrofurantoina y piperacilina tazobactam.
Abstract Urinary Tract Infections (UTI) are one of the main reasons for consultation in the primary care setting, due to the increase in antibacterial resistance. Objective . To characterize the prevalence of urinary tract infection and the in vitro antimicrobial susceptibility profile of Enterobacteriaceae in patients in the province of Santa Elena - Ecuador. Method. This was a descriptive research of documentary design. The population was 827 urine culture records, collected from the database of the microbiology laboratory of the Centro de Especialidades IESS La Libertad, in the period from August 2019 to March 2020. The data were processed using descriptive statistics, frequency analysis and chi-square. Results . From this study indicate that the prevalence of UTI was 22.1%; the main etiological agents were: E. coli (76.0%), Klebsiella oxytoca (6.5%), Klebsiella pneumoniae (5.8%) and Proteus mirabilis (3.9%). UTI and E. coli infection were statistically higher in women and older adults. The highest frequency of E. coli resistance was for nalidixic acid (81.2%), ampicillin (79.9%), ciprofloxacin (72.6%) and trimethoprim sulfamethoxazole (61.5%); in Klebsiella oxytoca it was ampicillin (80.0%), trimethoprim sulfamethoxazole (70.0%), nalidixic acid (60.0%) and ciprofloxacin (40.0%). While in Klebsiella pneumoniae, 100% resistance was found for ampicillin and cephalothin, amoxicillin and clavulanic acid (66.7%), ciprofloxacin (55.6%), nalidixic acid (44.4%), meropenem and imipenem (11.1%). Conclusions . E. coli continues to be the most frequent microorganism in UTI. Empirical treatment of UTI should include amikacin, nitrofurantoin and piperacillin tazobactam.
Resumo As infecções do trato urinário (IU) são um dos principais motivos de consulta no âmbito dos cuidados primários, devido ao aumento da resistência antibacteriana. Objetivo . Caracterizar a prevalência da infecção do trato urinário e o perfil de suscetibilidade antimicrobiana in vitro de Enterobacteriaceae em pacientes da província de Santa Elena - Equador. Método . Esta foi uma pesquisa descritiva do projeto documental. A população era de 827 registros de cultura de urina, coletados do banco de dados do laboratório de microbiologia do Centro de Especialidades IESS La Libertad, no período de agosto de 2019 a março de 2020. Os dados foram processados utilizando estatísticas descritivas, análise de freqüência e qui-quadrado. Resultados. Deste estudo indicam que a prevalência de UTI foi de 22,1%; os principais agentes etiológicos foram: E. coli (76,0%), Klebsiella oxytoca (6,5%), Klebsiella pneumoniae (5,8%) e Proteus mirabilis (3,9%). A infecção por UTI e E. coli foi estatisticamente maior nas mulheres e nos adultos mais velhos. A maior freqüência de resistência do E. coli foi para o ácido nalidíxico (81,2%), ampicilina (79,9%), ciprofloxacina (72,6%) e trimetoprim sulfametoxazol (61,5%); em Klebsiella oxytoca era ampicilina (80,0%), trimetoprim sulfametoxazol (70,0%), ácido nalidíxico (60,0%) e ciprofloxacina (40,0%). Enquanto em Klebsiella pneumoniae, foi encontrada 100% de resistência para ampicilina e cefalotina, amoxicilina e ácido clavulânico (66,7%), ciprofloxacina (55,6%), ácido nalidíxico (44,4%), meropenem e imipenem (11,1%). Conclusões . A E. coli continua sendo o microorganismo mais freqüente na UTI. O tratamento empírico da UTI deve incluir amikacina, nitrofurantoína e piperacilina tazobactam.
ABSTRACT
INTRODUCCIÓN: las múltiples y desconocidas características del coronavirus 2019-nCoV causante del síndrome respiratorio agudo y de millones de muertes en todo el mundo impulsó al desarrollo rápido de técnicas y kits de diagnóstico de laboratorio basados en la amplificación de secuencias virales o en la determinación de anticuerpos en sangre, sin embargo, tras su aplicación se generaron desacuerdos entre el resultado con la verdadera positividad o negatividad de la enfermedad. OBJETIVO: a través de la siguiente revisión se busca caracterizar y valorar el uso de las técnicas moleculares y serológicas, en función de factores como la sensibilidad y especificidad, tipo de espécimen y blanco de detección. METODOLOGIA: se emplearon las bases de datos Scopus y Web of Since obteniéndose 136 artículos de los cuales 25 cumplieron los criterios de inclusión como el desarrollo, validación clínica y estandarización de la técnica, así como nuevas metodologías propuestas. RESULTADOS: 17 elementos corresponden al diagnóstico de SARS-CoV-2 por técnicas moleculares y 8 por técnicas serológicas. El mayor número de publicaciones halladas provienen de China (5) y Estados Unidos (4), países de Europa (8) y Asia (6) mientras que, en América Latina se encontraron publicaciones procedentes de Brasil (1) y Ecuador (1). CONCLUSION: en relación a lo expuesto los ensayos moleculares destacan en su alta sensibilidad y especificidad y son usadas en cualquier etapa de la enfermedad. Las pruebas serológicas por su parte se recomiendan como complemento a las pruebas moleculares así como para monitoreo de la enfermedad en lugar de único marcador diagnóstico. (AU)
INTRODUCTION: the multiple and unknown characteristics of coronavirus 2019-nCoV causing acute respiratory syndrome and millions of deaths worldwide prompted the rapid development of laboratory diagnostic techniques and kits based on the amplification of viral sequences or the determination of antibodies in blood, however, after their application disagreements were generated between the result with the true positivity or negativity of the disease. OBJECTIVE: the following review seeks to characterize and evaluate the use of molecular and serological techniques, according to factors such as sensitivity and specificity, type of specimen and detection target. METHODOLOGY: the Scopus and Web of Since databases were used, obtaining 136 articles of which 25 met the inclusion criteria such as development, clinical validation and standardization of the technique, as well as new proposed methodologies. RESULTS: 17 items correspond to the diagnosis of SARS-CoV-2 by molecular techniques and 8 by serological techniques. The greatest number of publications found came from China (5) and the United States (4), European countries (8) and Asia (6) while, in Latin America, publications were found from Brazil (1) and Ecuador (1). CONCLUSIONS: in relation to the above, molecular assays stand out for their high sensitivity and specificity and are used at any stage of the disease. Serological tests are recommended as a complement to molecular tests as well as for disease monitoring instead of being the only diagnostic marker.(AU)
INTRODUÇÃO: as características múltiplas e desconhecidas do coronavírus 2019-nCoV, causando síndrome respiratória aguda e milhões de mortes em todo o mundo, levaram ao rápido desenvolvimento de técnicas e kits de diagnóstico laboratorial baseados na amplificação de sequências virais ou na determinação de anticorpos no sangue, porém, após sua aplicação foram geradas discordâncias entre o resultado com a verdadeira positividade ou negatividade da doença. OBJETIVO: a revisão a seguir visa caracterizar e avaliar o uso de técnicas moleculares e serológicas, dependendo de fatores como sensibilidade e especificidade, tipo de espécime e alvo de detecção. METODOLOGÍA: scopus e Web of Since foram utilizados, obtendo 136 artigos dos quais 25 preenchiam os critérios de inclusão, como desenvolvimento, validação clínica e padronização da técnica, assim como novas metodologias propostas. RESULTADOS: 17 itens correspondem ao diagnóstico do SARS-CoV-2 por técnicas moleculares e 8 por técnicas serológicas. O maior número de publicações encontradas veio da China (5) e dos Estados Unidos (4), países europeus (8) e da Ásia (6) enquanto, na América Latina, foram encontradas publicações do Brasil (1) e do Equador (1). CONCLUSÕES: em relação ao acima exposto, os ensaios moleculares se destacam por sua alta sensibilidade e especificidade e são utilizados em qualquer estágio da doença. Os testes serológicos são recomendados como um complemento aos testes moleculares, bem como para o monitoramento de doenças, em vez de serem o único marcador de diagnóstico.(AU)